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超聲波破碎細(xì)胞的常見(jiàn)問(wèn)題

更新時(shí)間:2010-01-19   點(diǎn)擊次數(shù):4733次
大腸桿菌表達(dá)外源蛋白,在超聲破碎的時(shí)候,用含有1%triton-X-100的PBS懸浮,然后超聲的效果較

好,1%triton-X-100的作用還是很明顯的,對(duì)其他的一些細(xì)菌同樣起作用,比如鏈霉菌。

    細(xì)菌沉淀直接加樣品1buffer,再加5ul的巰基乙醇,混勻,離心,煮沸10min,直接上樣,染色脫色步

驟如下:將膠放入適量的染色液微波爐里加熱1min(下次適當(dāng)補(bǔ)點(diǎn)醋酸即可),將染色液換成大量的水(自來(lái)水即

可)在微波爐煮10min 就可以。

    在表達(dá)重組蛋白后超聲波破碎細(xì)胞,采用冰浴,400w,破2s停1s,但是不一會(huì)就產(chǎn)生大量泡沫,影響
 
了破碎功率,pbs和tris緩沖液都是這樣,zui后都是破碎不*,而我的目的蛋白就在這些未破碎的細(xì)胞中。
 
1*會(huì)產(chǎn)生氣泡是因?yàn)槟愕奶筋^位置沒(méi)放好。探頭一定要接近底部,約1cm(我一般是距底部0.5mm)。功
 
率根據(jù)儀器不同會(huì)有所不同,但你可以觀察液面,有波動(dòng)但不要太劇烈就好。
 
2*破3S停10S,破個(gè)二三十次看看。

3*變幅桿位置擺放也要注意,聽(tīng)聲音如果不對(duì)的話(huà)就要及時(shí)調(diào)整。另外可以從菌濃度方面考慮。 在破碎時(shí)
 
試著加大體積,強(qiáng)度不要超過(guò)60%.
 
4*嘗試超8s停8s,對(duì)有些菌體蛋白來(lái)說(shuō),你的方法很難散熱,導(dǎo)致蛋白變性產(chǎn)生氣泡,停頓時(shí)間稍長(zhǎng)一
 
些,這種情況多見(jiàn)于包涵體形式的蛋白。

鏈霉菌(放線(xiàn)菌)超聲破碎的,用的方法條件是什么?
 
前處理一般就是配置成一定濃度的菌懸液。

使用超聲破碎時(shí)采用的具體條件是:

(1)取細(xì)菌的24 h培養(yǎng)液于5 000 r/min 下離心5 min收集菌體.
 
(2)用pH 7.5的Na2HPO -NaH2PO 緩沖液洗滌3次,再用該緩沖液將菌體配成1:3的菌懸液.置于40
 
mL大塑料試管內(nèi).
 
(3)將大塑料試管置于冰浴中,采用超聲波破碎(功率200 W,1/2”探頭,破碎30 s,間歇30 S).
 
(4)破碎液于12 000 r/min下高速冷凍離心30 min,收集細(xì)胞碎片和上清夜.

 
    超聲破菌流程與 上述基本一致,就是洗滌菌體也可以用預(yù)冷的生理鹽水或pH8的Tris-HCl,洗滌一次就
 
可以。另外,超聲劑量隨樣品量、菌體改變比較大,功率可以到400-600w,超5s,停5s,冰浴,要加終
 
濃度1 mM的PMSF。為確定合適的超聲強(qiáng)度和次數(shù),有必要隨時(shí)鏡檢觀察菌體是否*破碎。
 
    放線(xiàn)菌屬于原核生物系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)上的(G+C)摩爾百分含量(mol%)高的革蘭氏陽(yáng)性菌
 
(Eubacteria)分枝類(lèi)群,它雖然具有原核生物*的分子生物學(xué)特性,但在其不同類(lèi)群中,細(xì)胞壁的化學(xué)
 
組分變化很大。

    在做大腸桿菌超聲時(shí),采用的是400W,超5停5的方法,效果不錯(cuò),但是用在鏈霉菌上,似乎沒(méi)什么效
 
果。會(huì)不會(huì)就是由于細(xì)胞壁組成差異造成的呢,因?yàn)榇竽c桿菌式屬于革蘭氏陰性菌的。

    再有鏡檢是檢驗(yàn)破碎效果,但是細(xì)胞破碎程度和我需要的酶獲得之間有正比關(guān)系嗎?破碎時(shí)間長(zhǎng)也會(huì)影響到
 
酶的活性。所以想問(wèn)問(wèn)anaisai戰(zhàn)友,你提供的“功率200 W,1/2”探頭,破碎30 s,間歇30 S”的條
 
件好像是用于破碎鏈霉菌孢子的,也可以用于發(fā)酵離心后的菌泥嗎?如果可以,你破碎的全程時(shí)間大概是多
 
少呢? 

    如果你需要的是胞內(nèi)酶,細(xì)胞破碎程度和需要的酶獲得之間基本上有正比關(guān)系。破碎時(shí)間長(zhǎng)的確會(huì)影響到
 
酶的活性。這就需要在*的破碎時(shí)間和酶活性之間做出判斷,zui直接的辦法是先繪制相關(guān)曲線(xiàn)(酶活性和
 
時(shí)間的關(guān)系曲線(xiàn))。

    實(shí)驗(yàn)中,破碎的是棒狀桿菌(也是很難破壁的G+菌),破碎時(shí)間控制在30min左右,酶活較好。

 
如果是基質(zhì)菌絲的話(huà),好可以考慮用溶菌酶處理一下.

一般來(lái)講這幾種方法讀可以的:
 
一,液氮研磨
 
二,用french press破碎
 
三,超聲波破碎
四,溶菌酶處理預(yù)處理

    超聲波是物質(zhì)介質(zhì)中的一種彈性機(jī)械波,它既是一種波動(dòng)形式,又是一種能量形式。超聲對(duì)細(xì)胞的作用主要
 
有熱效應(yīng),空化效應(yīng)和機(jī)械效應(yīng)。熱效應(yīng)是當(dāng)超聲在介質(zhì)中傳播時(shí),摩擦力阻礙了由超聲引起的分子震動(dòng),
 
使部分能量轉(zhuǎn)化為局部高熱(42-43℃)??栈?yīng)是在超聲照射下,生物體內(nèi)形成空泡,隨著空泡震動(dòng)和
 
其猛烈的聚爆而產(chǎn)生出機(jī)械剪切壓力和動(dòng)蕩。另外,空化泡破裂時(shí)產(chǎn)生瞬時(shí)高溫(約5000℃)、高壓(可達(dá)
 
500×104Pa),可使水蒸氣熱解離產(chǎn)生.OH自由基和.H原子,由.OH自由基和.H原子引起的氧化還原反應(yīng)
 
可導(dǎo)致多聚物降解、酶失活、脂質(zhì)過(guò)氧化和細(xì)胞殺傷。機(jī)械效應(yīng)是超聲的原發(fā)效應(yīng),超聲波在傳播過(guò)程中介
 
質(zhì)質(zhì)點(diǎn)交替地壓縮與伸張構(gòu)成了壓力變化,引起細(xì)胞結(jié)構(gòu)損傷。損傷作用的強(qiáng)弱與超聲的頻率和強(qiáng)度密切相
 
關(guān)。

 
 
拌,發(fā)現(xiàn)菌液發(fā)粘,菌體不能夠很好分散,用高壓勻質(zhì)機(jī)破碎,加壓后,菌液不能進(jìn)入勻質(zhì)機(jī),速度很慢,
 
請(qǐng)問(wèn)是何原因?能有好的辦法解決,很好用勻質(zhì)機(jī)快速破碎菌體?
 
將破碎液的量加大,不能很好分散可能是量太大 。超聲處理5-10分鐘,菌液粘度即可大大降低,也可促進(jìn)
 
菌體分散。

    不同型號(hào)的設(shè)備功率不一樣,功率的大小決定了使用變幅桿的大小范圍(直徑2mm至幾十毫米),你使

用多大的變幅桿就在設(shè)備的上調(diào)至該刻度(很簡(jiǎn)單的)!變幅桿的大小決定了處理量5ml一下選3mm,5~

50ml可選6~8mm,50ml以上選10mm的變幅桿,依此類(lèi)推!占空比不用關(guān)心的,主要是指超聲時(shí)間和停

頓時(shí)間的比值。

酵母破碎的問(wèn)題

    一般的PROTOCOL都是用glass beads  破碎酵母細(xì)胞sigma G-8772 酵母破碎效果好的我所做過(guò)的方
 
法中還是玻璃珠,效率很高,而且對(duì)目的蛋白活性不會(huì)有什么影響。一般應(yīng)該用這個(gè)方法。

     化學(xué)裂解的方法,10g酵母 加1ml的乙酸乙酯,充分?jǐn)嚢柚烈后w狀。此法的裂解效果不錯(cuò)的
 
加尿素裂解液(尿素8mol/L, NaCl 0.5mol/L,Tris 20mmol/L, EDTA 20mmol/L, 2%SDS, PH值
 
8.0),據(jù)說(shuō)效果可以。
 
畢氏酵母細(xì)胞破碎法
 
    在破碎遇到的問(wèn)題是菌體濃度太低,OD620nm在4-6之間。細(xì)胞破碎儀的zui低破碎體積為4ml左右,這
 
樣再稀釋一倍,OD就到2-3啦,我們懷疑破碎完溶出蛋白和酶活測(cè)定時(shí)會(huì)測(cè)不準(zhǔn)。所以請(qǐng)教大家細(xì)胞破碎時(shí)
 
zui低的菌濃多少為下限?我們的菌是一種棒桿菌。 破碎后,你可將液體放入透析袋中濃縮。
 
    我們所做的方法是按照1:20的比例將離心后的菌體(e.coli)溶解于超聲緩沖液(50mM 磷酸 pH
 
8.0 )300w 10s/10s 破碎20分鐘。做了鏡檢!基本全被破碎了!我做蛋白純化的,做的包涵體。實(shí)驗(yàn)中
 
我們的菌體濃度相對(duì)獨(dú)立,與培養(yǎng)液中的菌體od無(wú)關(guān),不收其限制,便于操作者調(diào)控。
 
一般按每g濕菌體加5-10ml裂菌緩沖液。
 
超聲肯定會(huì)產(chǎn)熱,所以一定要有降溫裝置,除非你需要得成分耐高溫。
    100g大腸桿菌溶于1L破碎液里(破碎掖:50mM Tris-Cl(PH8.5) 5mM EDTA 0.14M NaCl),攪
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